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便攜式基因組測序裝置可助實時監控疫情
來源:新華網 發布時間:2016-02-04 12:40:00
(原標題:便攜式基因組測序裝置可助實時監控疫情)

一個國際團隊3日在英國《自然》雜志上報告說,去年埃博拉疫情肆虐期間,一種便攜式基因組測序裝置能方便地部署在條件簡陋的疫區,幫助監控疫情,未來可用這種裝置應對其他疫情。

在監控疫情方面,病毒基因組測序獲取的信息有助于了解病毒在大規模傳播過程中出現了何種變異,這對判斷疫情發展趨勢非常重要。但由于病毒傳播速度快,如何更快更高效地完成相關分析流程就成為關鍵。

英國、德國和加拿大等國研究人員組成的科研團隊設計了一個輕便的疫情監控系統,它能裝進符合航空公司運輸標準的行李箱中運輸。這個系統的核心組成部分是一種名為MinION的小型測序儀,其重量小于100克,可以通過電腦的USB接口來充電。

在去年埃博拉肆虐期間,這個系統曾被率先部署在西非國家幾內亞的一個疫區。研究人員在埃博拉患者身上收集到樣本后,在現場利用這個系統進行病毒基因組測序,無需再把這些樣本長途運回實驗室。

據研究人員介紹,他們利用這一系統在當地對142份埃博拉病毒樣本進行了測序分析,取得了非常不錯的效果。通常在獲得樣本后的24小時內就可以完成整個分析流程,研究人員能及時獲得疫情發展的最新信息。

報告作者之一、伯明翰大學學者尼克·洛曼說,基因組測序反映的信息在疫情暴發期間對研究人員來說非常重要,以往這項繁瑣工作只能在配備大型設備的實驗室里才能完成,而便攜式測序裝置有望改變這種狀況。

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