而多家農商行2013年年報曝出“超高”不良率，更是引起廣泛關注。其中連云港東方農商行截至2013年末的不良貸款余額高達20.56億元，不良貸款率從2011年末的1.75%，到2012年末的13.02%，再到2013年末達到驚人的26.76%，在中國銀行業十分鮮見。除了連云港東方農商行，截至2013年末，還有蘇、皖等東部省份的少數農商行出現高不良貸款率。
對此，農商行的兩個軟肋成為市場關注焦點。其一是農商行放貸區域較為集中。仁和資本資產管理集團合伙人陳宇認為，農商行等農村金融機構容易出現問題，與其對業務地域限制多、優質業務少直接相關，“給他們的盤子里盛的都不是什么好菜。”陳宇形象地表述。對此，上述多家農商行均進行了風險說明。
農商行貸款行業分布較為集中成為另一軟肋。記者在長三角了解到，一些不良貸款率上升的農商行，其不良貸款高發區，很大一部分集中在批發零售業和房地產業，其中批發零售業又主要是鋼貿行業爛賬。記者在連云港東方農商行的報表中發現，去年其批發零售業貸款達到34.3億元，占其貸款總額的44.64%。
不少專家表示，對于農商行，在IPO等“定向”融資上給予支持沒有問題，但投資者也需要針對不同銀行的風險類型，考慮到其中的風險因素。這可能也是關系到未來農商行IPO前景的關鍵因素。
